RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NPNTQ6UXI9 565 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 DENND1CQ8IV53 801 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP52Q8N1V2 620 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TXLNBQ8N3L3 684 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM58Q8NG06 486 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC8Q8TAM2 541 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 BHMTQ93088 406 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NT5C3BQ969T7 300 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HAUS1Q96CS2 278 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC39A13Q96H72 371 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HES6Q96HZ4 224 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KXD1Q9BQD3 176 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FZD10Q9ULW2 581 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MAFFQ9ULX9 164 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ASB3Q9Y575 518 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 COL4A3Q01955 1670 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO9BQ13459 2157 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CTAGE9A4FU28 777 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LEFTY2O00292 366 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPSAP2O60256 369 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP104O60308 925 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GREM1O60565 184 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ENDOD1O94919 500 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 OLFM2O95897 454 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV3-27P01718 113 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GOT1P17174 413 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MAN1A1P33908 653 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ADRA1BP35368 520 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ARSEP51690 589 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CDH6P55285 790 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 AMPD2Q01433 879 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GRM2Q14416 872 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT81Q14533 505 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM78AQ5JUQ0 283 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ARCQ7LC44 396 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 STRADAQ7RTN6 431 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RFX6Q8HWS3 928 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LGI2Q8N0V4 545 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RSAD2Q8WXG1 361 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FGF13Q92913 245 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 IGSF8Q969P0 613 aa6.24□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
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