RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 PRKCQQ04759 706 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 TNK2Q07912 1038 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 KRT81Q14533 505 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 DHCR24Q15392 516 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 DPYSL2Q16555 572 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 CA9Q16790 459 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 KCNT1Q5JUK3 1230 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 LY6G5CQ5SRR4 150 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 MANEALQ5VSG8 457 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 FBXL22Q6P050 247 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 RFWD3Q6PCD5 774 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 LRRC31Q6UY01 552 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 TPGS1Q6ZTW0 290 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 PEX26Q7Z412 305 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 LGI2Q8N0V4 545 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 DNASE1L2Q92874 299 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 CD101Q93033 1021 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 C1orf74Q96LT6 269 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 LINC00597Q9H2U6 94 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 ECT2Q9H8V3 914 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 SPHK2Q9NRA0 654 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 KCND1Q9NSA2 647 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 AMFRQ9UKV5 643 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 VANGL2Q9ULK5 521 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.2□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 CCDC66A2RUB6 948 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 SHISA7A6NL88 538 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 E9PAM4 449 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 KIF5CO60282 957 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 TSPAN3O60637 253 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 LRIG2O94898 1065 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 PENKP01210 267 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 CTNNA2P26232 953 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 HOXC13P31276 330 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 L1CAMP32004 1257 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 HTR7P34969 479 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 MARCKSL1P49006 195 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 SGSHP51688 502 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 CDH6P55285 790 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 TPI1P60174 286 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 SEMA3BQ13214 749 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 RUNX3Q13761 415 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 ANGPT1Q15389 498 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 ANO4Q32M45 955 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 MPPE1Q53F39 396 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 C14orf80Q86SX3 495 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 ZNF683Q8IZ20 524 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 PJA1Q8NG27 643 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 KRT35Q92764 455 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 MYEOVQ96EZ4 313 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 BBS2Q9BXC9 721 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 HEBP1Q9NRV9 189 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 NEU3Q9UQ49 428 aa11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 A0A1B0GVM2 712 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 LRRD1A4D1F6 860 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 TCAF2A6NFQ2 919 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 FAM170BA6NMN3 283 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 PROB1E7EW31 1015 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 FAM72CH0Y354 149 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 H3BRJ5 948 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 CREB3O43889 395 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 TBL1XO60907 577 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 SRGAP2O75044 1071 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 TYRP14679 529 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 ARL4AP40617 200 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 IRAK1P51617 712 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 GAD2Q05329 585 aa11.18□□□□□ -0.62
CTIF-204ENST00000587769 NR1H3Q13133 447 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms