RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	HDC	P19113	662 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BDNF	P23560	247 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LMO2	P25791	158 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CCNF	P41002	786 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ETV3	P41162	512 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PRPH	P41219	470 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CASP5	P51878	434 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GTF2B	Q00403	316 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	AMPD2	Q01433	879 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BNC1	Q01954	994 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GRIK2	Q13002	908 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	REST	Q13127	1097 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KYAT1	Q16773	422 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NAXD	Q8IW45	347 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CD302	Q8IX05	232 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PNKP	Q96T60	521 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ACOX2	Q99424	681 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ACBD6	Q9BR61	282 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ASB7	Q9H672	318 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093		F8VP50	259 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093		H0Y626	953 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093		H0YCG3	227 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CLDN5	O00501	218 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LAD1	O00515	517 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	OPHN1	O60890	802 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TULP3	O75386	442 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM16	O95361	564 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	APOD	P05090	189 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KRT19	P08727	400 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	IRF1	P10914	325 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HOXB2	P14652	356 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PAX3	P23760	479 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MAGEA11	P43364	429 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GIPR	P48546	466 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PGF	P49763	221 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CLDN6	P56747	220 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC7A9	P82251	487 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MYL7	Q01449	175 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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