RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DRAP01903 254 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ADRB2P07550 413 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ALOX5P09917 674 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MYZAPP0CAP1 466 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DHRS4L1P0CG22 281 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ANXA8P13928 327 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IL11P20809 199 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FGFR4P22455 802 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MC4RP32245 332 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TTKP33981 857 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PPM1AP35813 382 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KRT2P35908 639 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SCNN1BP51168 640 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CASP5P51878 434 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SLC12A3P55017 1021 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ACTR1AP61163 376 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 CBX3Q13185 183 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 RIN1Q13671 783 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ITGA7Q13683 1181 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 EFR3AQ14156 821 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GIT2Q14161 759 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ACAP2Q15057 778 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PTPAQ15257 358 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DPYSL2Q16555 572 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MOGQ16653 247 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 AAK1Q2M2I8 961 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM266Q2M3C6 531 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 MDH1BQ5I0G3 518 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf141Q5JVX7 400 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 STRIP1Q5VSL9 837 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ANXA8L1Q5VT79 327 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ATL3Q6DD88 541 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IYDQ6PHW0 289 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC2AQ6UVW9 174 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZRM9 215 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC17AQ6ZS10 378 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RFX8Q6ZV50 586 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 CPA6Q8N4T0 437 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 OR6S1Q8NH40 331 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 WDR48Q8TAF3 677 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ENKURQ8TC29 256 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 SGF29Q96ES7 293 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 MSANTD3Q96H12 275 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IFT74Q96LB3 600 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 TBCBQ99426 244 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 HAUS8Q9BT25 410 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 CD244Q9BZW8 370 aa3.19□□□□□ -1.9
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PTPRM-204ENST00000577468 LY9Q9HBG7 655 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PARVBQ9HBI1 364 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NMRK2Q9NPI5 230 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 POLE3Q9NRF9 147 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ANAPC5Q9UJX4 755 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RCOR1Q9UKL0 485 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PSME2Q9UL46 239 aa3.19□□□□□ -1.9
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