RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	SRGAP2	O75044	1071 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	HKR1	P10072	659 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	TACR2	P21452	398 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	RPS6KB1	P23443	525 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	PSMA5	P28066	241 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	SHMT1	P34896	483 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	PLA2G5	P39877	138 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	HTR3A	P46098	478 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ABHD18	Q0P651	414 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	STK3	Q13188	491 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	KRT32	Q14532	448 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	RABEP1	Q15276	862 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	TBCC	Q15814	346 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	LY6K	Q17RY6	165 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934		Q6YL49	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	BEND5	Q7L4P6	421 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	SPART	Q8N0X7	666 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF566	Q969W8	418 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	TTC14	Q96N46	770 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC18	Q9H819	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	SYBU	Q9NX95	663 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	DKK3	Q9UBP4	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	DKK4	Q9UBT3	224 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	PADI4	Q9UM07	663 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	PSME4	Q14997	1843 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	AREL1	O15033	823 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	CCP110	O43303	1012 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ORC4	O43929	436 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	NMT2	O60551	498 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	PIAS2	O75928	621 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	VNN1	O95497	513 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	NDST3	O95803	873 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	SETSIP	P0DME0	302 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	MYL4	P12829	197 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	MCM5	P33992	734 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	MPL	P40238	635 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	FOLR3	P41439	243 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	PDE6C	P51160	858 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK10	P53779	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	NXPH1	P58417	271 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ZXDA	P98168	799 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	TFAP4	Q01664	338 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ITIH3	Q06033	890 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	FSTL1	Q12841	308 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	FOXI1	Q12951	378 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	TRDN	Q13061	729 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZNX1	250 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZPA2	131 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	SNX21	Q969T3	373 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	FKBP10	Q96AY3	582 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	PGBD1	Q96JS3	809 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	KRT23	Q9C075	422 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	GGA3	Q9NZ52	723 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	CEP83	Q9Y592	693 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087WZ62	844 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	ADM5	C9JUS6	153 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	PROM1	O43490	865 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	FZD7	O75084	574 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6

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