RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558970.2

GABPB1-208, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 1, human

TSL 5

Gene GABPB1, Length 730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABPB1-208	ENST00000558970	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	STK25	O00506	426 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ZSCAN12	O43309	604 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	LRIG2	O94898	1065 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	KRT1	P04264	644 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CD48	P09326	243 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	GOT1	P17174	413 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CTH	P32929	405 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CDH6	P55285	790 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	TPI1	P60174	286 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ZXDA	P98168	799 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	MESP2	Q0VG99	397 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	SCAP	Q12770	1279 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CDH18	Q13634	790 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	GAB4	Q2WGN9	574 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ALF	Q53S48	1182 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ODF2	Q5BJF6	829 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	PEX26	Q7Z412	305 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	MFN1	Q8IWA4	741 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	NETO2	Q8NC67	525 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	EPAS1	Q99814	870 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CALN1	Q9BXU9	219 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	LRRD1	A4D1F6	860 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	KRBA1	A5PL33	1030 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	DAPK3	O43293	454 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	DCX	O43602	365 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	TULP3	O75386	442 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	EPHB2	P29323	1055 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	L1CAM	P32004	1257 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	OPRD1	P41143	372 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	SLC1A1	P43005	524 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	DGKG	P49619	791 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	AIF1	P55008	147 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	MMRN1	Q13201	1228 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	BOLA3	Q53S33	107 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	KCTD6	Q8NC69	237 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	KRT35	Q92764	455 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	DNAI1	Q9UI46	699 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	AMFR	Q9UKV5	643 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970		A0A1B0GVM2	712 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ANTXRL	A6NF34	631 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	GFRA2	O00451	464 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	KRT7	P08729	469 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CD70	P32970	193 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ARL4A	P40617	200 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	GALK1	P51570	392 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	SEC13	P55735	322 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	MTA1	Q13330	715 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	FSCB	Q5H9T9	825 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	FLCN	Q8NFG4	579 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	TEKT4	Q8WW24	435 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	FAM3C	Q92520	227 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	RAPGEF5	Q92565	580 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CD101	Q93033	1021 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	C1orf74	Q96LT6	269 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	FOXQ1	Q9C009	403 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	TMEM51	Q9NW97	253 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	MARK1	Q9P0L2	795 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	DEC1	Q9P2X7	70 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GABPB1-208	ENST00000558970	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		12.8	□□□□□ -0.36

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