RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 BBS4Q96RK4 519 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM117AQ9C073 453 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KRT84Q9NSB2 600 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ANO9A1A5B4 782 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KRT87PA6NCN2 255 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 POTECB2RU33 542 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 UBXN8O00124 270 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SNAP23O00161 211 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 OGTO15294 1046 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL2O95198 593 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC130P13994 396 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ARFIP2P53365 341 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NRLP54845 237 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ECT2LQ008S8 904 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 IL1RL1Q01638 556 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CDC16Q13042 620 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DCAF6Q58WW2 860 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 REPS2Q8NFH8 660 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 AGR3Q8TD06 166 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KRT35Q92764 455 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TCEAL3Q969E4 200 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MOCOSQ96EN8 888 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HPF1Q9NWY4 346 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CLDND1Q9NY35 253 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC72A6NJI9 287 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 M0QYV0 167 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RNF103O00237 685 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FBP2O00757 339 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PRMT3O60678 531 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MFAP3LO75121 409 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 F9P00740 461 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ASLP04424 464 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM11P17152 192 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CD58P19256 250 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RAB4AP20338 218 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 IL10P22301 178 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CALB2P22676 271 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RPA1P27694 616 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-FP30511 346 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF7Q14155 803 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 COLEC12Q5KU26 742 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C14orf80Q86SX3 495 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ANKMY2Q8IV38 441 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD6Q8NC69 237 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ACER1Q8TDN7 264 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 STK32AQ8WU08 396 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 ANKS1AQ92625 1134 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINI1Q99574 410 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 AMACRQ9UHK6 382 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM172BPA6NC97 362 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 BTN3A3O00478 584 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 CDC25CP30307 473 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PSMC6P62333 389 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-210ENST00000551525 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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