RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 ST8SIA6P61647 398 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 CST6Q15828 149 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 SGO2Q562F6 1265 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 FSCBQ5H9T9 825 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 NADSYN1Q6IA69 706 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 FBXL13Q8NEE6 735 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 SAP25Q8TEE9 199 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 GOLGA1Q92805 767 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 MRGPRX3Q96LB0 322 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 PRORYQ9H606 182 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 FBRSQ9HAH7 460 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 HESX1Q9UBX0 185 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 RCOR1Q9UKL0 485 aa16.73■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 ACSL4O60488 711 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 GABBR2O75899 941 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 SLC8A1P32418 973 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 ACADVLP49748 655 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 DAOAP59103 153 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 CBWD6Q4V339 395 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 OR14C36Q8NHC7 312 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 COL26A1Q96A83 441 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 LMLNQ96KR4 655 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 DOCK9Q9BZ29 2069 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 TENM4Q6N022 2769 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 MGAQ8IWI9 3026 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PR77 199 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 LRRC72A6NJI9 287 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 DFNA5O60443 496 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 SDC3O75056 442 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 METAP1P53582 386 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 TBX4P57082 545 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 PPP2CBP62714 309 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 PPP2CAP67775 309 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 CCDC173Q0VFZ6 552 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 NFIL3Q16649 462 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 C9orf64Q5T6V5 341 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 USP30Q70CQ3 517 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 STK40Q8N2I9 435 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 AADATQ8N5Z0 425 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 OR2T34Q8NGX1 318 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 TTC17Q96AE7 1141 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 SERAC1Q96JX3 654 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 GDF3Q9NR23 364 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 CEP83Q9Y592 693 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
CS-227ENST00000551441 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 E9PAM4 449 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 BRINP1O60477 761 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 RHOBTB3O94955 611 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 LATS1O95835 1130 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 C7P10643 843 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 VAV1P15498 845 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 GTF2H1P32780 548 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 SLC11A2P49281 568 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 NDUFA8P51970 172 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 ZNF445P59923 1031 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 CUL2Q13617 745 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 PMF1Q6P1K2 205 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 FBXL19Q6PCT2 694 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 APCDD1Q8J025 514 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 TTC39CQ8N584 583 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 FIBINQ8TAL6 211 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 TFAP2BQ92481 460 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 SKA1Q96BD8 255 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 FAM129BQ96TA1 746 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 MIS12Q9H081 205 aa16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
CS-227ENST00000551441 CFAP45Q9UL16 551 aa16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms