RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SCML4Q8N228 414 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 APOL2Q9BQE5 337 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 C5orf60A6NFR6 353 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 CHADO15335 359 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 GCATO75600 419 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 IRF1P10914 325 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 GARSP41250 739 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 PLD1Q13393 1074 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 CTAGE3PQ8IX95 158 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 MPP5Q8N3R9 675 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 FBF1Q8TES7 1133 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 RTP4Q96DX8 246 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 CLUHO75153 1309 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-215ENST00000549143 VWA8A3KMH1 1905 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 NEBLO76041 1014 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CNTN5O94779 1100 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 GJB5O95377 273 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 KRT15P19012 456 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MX2P20592 715 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PTPN3P26045 913 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PPP2R2AP63151 447 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ZBTB17Q13105 803 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 LRRC14Q15048 493 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ALFQ53S48 1182 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 RFWD3Q6PCD5 774 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TMC7Q7Z402 723 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 BHMTQ93088 406 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PGM2Q96G03 612 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TTC25Q96NG3 672 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 HAPLN3Q96S86 360 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 GKN1Q9NS71 199 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MYO9BQ13459 2157 aa8.65□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CCDC78A2IDD5 438 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 HACD1B0YJ81 288 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 RASA4BC9J798 803 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TEX28O15482 410 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 RASA4O43374 803 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 FGF18O76093 207 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 FGBP02675 491 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 IVLP07476 585 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 RFC2P35250 354 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 IFNAR2P48551 515 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SEC24CP53992 1094 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TWF1Q12792 350 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SMARCB1Q12824 385 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PPP2R5DQ14738 602 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 STAT4Q14765 748 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 MS4A13Q5J8X5 152 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CYP2S1Q96SQ9 504 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 NDC80O14777 642 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 KIAA0355O15063 1070 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-215ENST00000549143 OPHN1O60890 802 aa8.64□□□□□ -1.03
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