RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 KIF3AQ9Y496 699 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 U3KQA8 63 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa24.5■■□□□ 1.51
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PRDM4-202ENST00000547188 CLEC18AA5D8T8 446 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ENO4A6NNW6 628 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ATICP31939 592 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 CD70P32970 193 aa24.49■■□□□ 1.51
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PRDM4-202ENST00000547188 KIF11P52732 1056 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 NDST1P52848 882 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ALCAMQ13740 583 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 IGFBP7Q16270 282 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 CLEC18BQ6UXF7 455 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF276Q8N554 614 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 CLEC18CQ8NCF0 446 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 SGF29Q96ES7 293 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 BLACEA4D250 179 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 LATO43561 262 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 PHACTR2O75167 634 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 TNFSF15O95150 251 aa24.48■■□□□ 1.51
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PRDM4-202ENST00000547188 SGSHP51688 502 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 PSMD6Q15008 389 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF699Q32M78 642 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 IFI44Q8TCB0 444 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 EPSTI1Q96J88 318 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 SEMA3CQ99985 751 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa24.48■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 MAGEC1O60732 1142 aa24.47■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 KIF20AO95235 890 aa24.47■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ITGB2P05107 769 aa24.47■■□□□ 1.51
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PRDM4-202ENST00000547188 CYP24A1Q07973 514 aa24.47■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 STAT4Q14765 748 aa24.47■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 BMT2Q1RMZ1 405 aa24.47■■□□□ 1.51
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PRDM4-202ENST00000547188 CLEC14AQ86T13 490 aa24.47■■□□□ 1.51
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PRDM4-202ENST00000547188 CRYBG2Q8N1P7 616 aa24.47■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 HPS3Q969F9 1004 aa24.47■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ARRDC3Q96B67 414 aa24.47■■□□□ 1.51
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PRDM4-202ENST00000547188 THEGLP0DJG4 465 aa24.46■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 GOT1P17174 413 aa24.46■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 TGIF1Q15583 401 aa24.46■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 ARL14Q8N4G2 192 aa24.46■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 KIAA1586Q9HCI6 787 aa24.46■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 PANK4Q9NVE7 773 aa24.46■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.46■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 SRPK3Q9UPE1 567 aa24.46■■□□□ 1.51
PRDM4-202ENST00000547188 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
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PRDM4-202ENST00000547188 SFTPCP11686 197 aa24.45■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 ST8SIA6P61647 398 aa24.45■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.45■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 CRTC1Q6UUV9 634 aa24.45■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
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PRDM4-202ENST00000547188 FAM129BQ96TA1 746 aa24.45■■□□□ 1.5
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PRDM4-202ENST00000547188 TBR1Q16650 682 aa24.44■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 SV2BQ7L1I2 683 aa24.44■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 PLD4Q96BZ4 506 aa24.44■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.44■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 CYTH4Q9UIA0 394 aa24.44■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 ITPR2Q14571 2701 aa24.44■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 CASC3O15234 703 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 PIAS2O75928 621 aa24.43■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 CYP2J2P51589 502 aa24.43■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 METAP1P53582 386 aa24.43■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PRDM4-202ENST00000547188 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.43■■□□□ 1.5
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