RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 HDAC3O15379 428 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TBC1D12O60347 775 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 ENTPD3O75355 529 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 GCATO75600 419 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SPDYE6P0CI01 402 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 KCNA4P22459 653 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 IL1R2P27930 398 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 MTMR2Q13614 643 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 IKBKEQ14164 716 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CCDC14Q49A88 953 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 GRTP1Q5TC63 336 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 LDHDQ86WU2 507 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 WDR49Q8IV35 697 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 HSPH1Q92598 858 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CASP10Q92851 521 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 PLEKHA8Q96JA3 519 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CEP170P1Q96L14 293 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CCDC138Q96M89 665 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 RNF157Q96PX1 679 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TBCBQ99426 244 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 DOK1Q99704 481 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CNPY3Q9BT09 278 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 C10orf88Q9H8K7 445 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SMYD2Q9NRG4 433 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SPATA7Q9P0W8 599 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TMX2Q9Y320 296 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 ARID2Q68CP9 1835 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 HMX2A2RU54 273 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 G3V3G9 751 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 ZBTB14O43829 449 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 KLHL41O60662 606 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 AVILO75366 819 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 GH2P01242 217 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 PGAM1P18669 254 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 MIPP30301 263 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SLC7A1P30825 629 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 HADHAP40939 763 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CDH6P55285 790 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 BCAR1P56945 870 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 RHDQ02161 417 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 NFIAQ12857 509 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TGFBIQ15582 683 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 RGS21Q2M5E4 152 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 MAP7D1Q3KQU3 841 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 BOLA3Q53S33 107 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TMEM53Q6P2H8 277 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 LILRA2Q8N149 483 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CERS5Q8N5B7 392 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 ISL2Q96A47 359 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 WRNIP1Q96S55 665 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CGREF1Q99674 301 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CPNE1Q99829 537 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 MSTO1Q9BUK6 570 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 KIFC3Q9BVG8 833 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TRIM15Q9C019 465 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 CD320Q9NPF0 282 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 INIPQ9NRY2 104 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SELENONQ9NZV5 590 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 MORF4L1Q9UBU8 362 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 RNF11Q9Y3C5 154 aa11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 IQCA1LA6NCM1 817 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 ACOT8O14734 319 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 MAFGO15525 162 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 PRPSAP2O60256 369 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 SNAP91O60641 907 aa11.07□□□□□ -0.64
LMO3-215ENST00000537304 TRIM13O60858 407 aa11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms