RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529524.1

PSMA1-208, Transcript of proteasome subunit alpha 1, human

TSL 3

Gene PSMA1, Length 743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA1-208	ENST00000529524	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	KCNQ3	O43525	872 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PRC1	O43663	620 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	IFNA2	P01563	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	WNT1	P04628	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	CYP1A2	P05177	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	HOXC6	P09630	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	EGR4	Q05215	589 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PARM1	Q6UWI2	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524		Q6ZTK2	550 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	SARG	Q9BW04	601 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	WDR62	O43379	1518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524		M0QZQ0	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	NPC1	O15118	1278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	MDM4	O15151	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	TGM2	P21980	687 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	MT3	P25713	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	RFX2	P48378	723 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC37A1	P57057	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	KEAP1	Q14145	624 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	CSHL1	Q14406	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	APOL1	O14791	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PPP6R2	O75170	966 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	CNTN5	O94779	1100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	NDST3	O95803	873 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	MYL1	P05976	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	STT3A	P46977	705 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PCYT1A	P49585	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	DSCR9	P59020	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PMPCA	Q10713	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	GALE	Q14376	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	GALNT3	Q14435	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	FAR2	Q96K12	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	CDT1	Q9H211	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524		J3KTA2	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	KRT86	O43790	486 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PLIN1	O60240	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	KAT7	O95251	611 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	KLKB1	P03952	638 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM27	P14373	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	GNAL	P38405	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	PICALM	Q13492	652 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	KRT81	Q14533	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524		Q5PR19	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.53	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms