RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528066.1

RCOR3-209, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 3

Gene RCOR3, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-209	ENST00000528066	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	IL16	Q14005	1332 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066		A0A087WWL8	130 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	FAM227A	F5H4B4	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MYO1F	O00160	1098 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SEPT4	O43236	478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ORC4	O43929	436 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PGK1	P00558	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TIMP1	P01033	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ASNS	P08243	561 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PDHA1	P08559	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	NR2F6	P10588	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MYOG	P15173	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CSF2RA	P15509	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PCSK6	P29122	969 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TIMM10	P62072	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CCNA1	P78396	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SP2	Q02086	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CTBP1	Q13363	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	GRB14	Q14449	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TBCC	Q15814	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ICE2	Q659A1	982 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SIL1	Q9H173	461 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	BTN3A1	O00481	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	STRN	O43815	780 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CYP2C9	P11712	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CDK4	P11802	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ADORA2A	P29274	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CYP2C18	P33260	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	WNT3	P56703	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TBX3	O15119	743 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	GH2	P01242	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	FGB	P02675	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	LDHC	P07864	332 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	JUP	P14923	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	ACLY	P53396	1101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	GSTO1	P78417	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	RAB30	Q15771	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RCOR3-209	ENST00000528066	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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