RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511392.5

CDV3-208, Transcript of CDV3 homolog, human

TSL 5 BASIC

Gene CDV3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDV3-208	ENST00000511392	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CASP10	Q92851	521 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	DMD	P11532	3685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MYH10	P35580	1976 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CYB561D2	O14569	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GABRD	O14764	452 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PLD2	O14939	933 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CETN3	O15182	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	RFPL2	O75678	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	RASGRP1	O95267	797 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CRTAM	O95727	393 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FUCA1	P04066	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	KRT19	P08727	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	POU2F2	P09086	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PRKCA	P17252	672 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TNNI1	P19237	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FPR2	P25090	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	KLRC2	P26717	231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	HOXA9	P31269	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GTF2H1	P32780	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	OR1D2	P34982	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CA8	P35219	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PPP1R2	P41236	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	AP3M2	P53677	418 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GYS2	P54840	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GPR17	Q13304	367 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	STIM1	Q13586	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TSG101	Q99816	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms