RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 CHPFQ8IZ52 775 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 SPARTQ8N0X7 666 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 MPP5Q8N3R9 675 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 SPSB4Q96A44 273 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 CPNE7Q9UBL6 633 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 POLLQ9UGP5 575 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 CENPFP49454 3210 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 UFL1O94874 794 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 IL1R2P27930 398 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 EPHA3P29320 983 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 PSMC4P43686 418 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 DIO1P49895 249 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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PDE4D-217ENST00000509355 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 CCL15Q16663 113 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 INSCQ1MX18 579 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 C4orf46Q504U0 113 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 SLC10A5Q5PT55 438 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 TBC1D16Q8TBP0 767 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 IGFBPL1Q8WX77 278 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 OPTNQ96CV9 577 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 HMCESQ96FZ2 354 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 KAZALD1Q96I82 304 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 COL20A1Q9P218 1284 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 LAMA3Q16787 3333 aa5.48□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 VCANP13611 3396 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 CEP290O15078 2479 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 CES2O00748 559 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 TLR2O60603 784 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 NTN1O95631 604 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 PRKAR1BP31321 381 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.47□□□□□ -1.53
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PDE4D-217ENST00000509355 DEFB118Q96PH6 123 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R9BQ96SB3 815 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 DEFB129Q9H1M3 183 aa5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PDE4D-217ENST00000509355 UBR2Q8IWV8 1755 aa5.47□□□□□ -1.53
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PDE4D-217ENST00000509355 PSMD9O00233 223 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM38O00635 465 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 IL1R1P14778 569 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 KLRC1P26715 233 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 THBS4P35443 961 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 FMO1Q01740 532 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC41Q15345 812 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 SEC23BQ15437 767 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 CNGA2Q16280 664 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 PIP4P1Q86T03 277 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 BRI3BPQ8WY22 251 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 WACQ9BTA9 647 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 DKK4Q9UBT3 224 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 USP22Q9UPT9 525 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 SH3TC1Q8TE82 1336 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 MYO3BQ8WXR4 1341 aa5.46□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM232C9JQI7 657 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 H7C4K7 107 aa5.45□□□□□ -1.54
PDE4D-217ENST00000509355 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
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