RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
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PSPC1-204ENST00000492741 CFAP52Q8N1V2 620 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 ACTL9Q8TC94 416 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 STOML2Q9UJZ1 356 aa22.71■■□□□ 1.23
PSPC1-204ENST00000492741 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.71■■□□□ 1.23
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PSPC1-204ENST00000492741 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.7■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.7■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.7■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 WEE1P30291 646 aa22.68■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 VIPR2P41587 438 aa22.68■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 ZNF77Q15935 545 aa22.68■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 ALFQ53S48 1182 aa22.68■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.68■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 TEX35Q5T0J7 233 aa22.67■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.67■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 ARTNQ5T4W7 220 aa22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 NLRP14Q86W24 1093 aa22.66■■□□□ 1.22
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PSPC1-204ENST00000492741 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.66■■□□□ 1.22
PSPC1-204ENST00000492741 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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