RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 IGSF8Q969P0 613 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 NT5C3BQ969T7 300 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 CFAP57Q96MR6 1250 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 TKTL2Q9H0I9 626 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 SIK2Q9H0K1 926 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 CD93Q9NPY3 652 aa12.42□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa12.42□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa12.41□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 RAB6CQ53S08 254 aa12.41□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP12.41□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 RXFP2Q8WXD0 754 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 SPACA7Q96KW9 195 aa12.41□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 SMOC1Q9H4F8 434 aa12.41□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 THADAQ6YHU6 1953 aa12.41□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 PMS2CLQ68D20 193 aa12.4□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 TTC17Q96AE7 1141 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 LOXL4Q96JB6 756 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 SYT11Q9BT88 431 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 TTYH3Q9C0H2 523 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 SEMA4GQ9NTN9 838 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 TAS2R14Q9NYV8 317 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-214ENST00000490425 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
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NISCH-214ENST00000490425 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 A0A1B0GVM2 712 aa12.39□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 C2CD4BA6NLJ0 364 aa12.39□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 CALB1P05937 261 aa12.39□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 SKILP12757 684 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 TNFAIP3P21580 790 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 SDC4P31431 198 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 RDXP35241 583 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
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