RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489186.1

APOL2-208, Transcript of apolipoprotein L2, human

TSL 3

Gene APOL2, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APOL2-208	ENST00000489186	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	MYO19	Q96H55	970 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	NOX5	Q96PH1	765 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	DDIT4	Q9NX09	232 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	DACH1	Q9UI36	760 aa		11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186		A0A1B0GTW7	788 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186		F5H5T6	163 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186		H0Y626	953 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	OPHN1	O60890	802 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ASL	P04424	464 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	C7	P10643	843 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ACSL1	P33121	698 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	NUMB	P49757	651 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ST8SIA6	P61647	398 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	FOXC1	Q12948	553 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	GRIK2	Q13002	908 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	KCNJ12	Q14500	433 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	RNF34	Q969K3	372 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SLC32A1	Q9H598	525 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SUN2	Q9UH99	717 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	NUP205	Q92621	2012 aa		11.75	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	AKAP13	Q12802	2813 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	FAM170A	A1A519	330 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	TTC34	A8MYJ7	566 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SIN3B	O75182	1162 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	DAB1	O75553	588 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	DNTT	P04053	509 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SLC2A3	P11169	496 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	CD59	P13987	128 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SPINK2	P20155	84 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ABCB4	P21439	1286 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	CCR1	P32246	355 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	BPIFB4	P59827	614 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SLC6A3	Q01959	620 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ZBTB16	Q05516	673 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	NME3	Q13232	169 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	APCDD1	Q8J025	514 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SNX19	Q92543	992 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	CEP83	Q9Y592	693 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	GJB3	O75712	270 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	MOCS3	O95396	460 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SEMA4F	O95754	770 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	CYP11B1	P15538	503 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	GGCX	P38435	758 aa		11.73	□□□□□ -0.53
APOL2-208	ENST00000489186	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53

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