RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 ST7Q9NRC1 585 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 CYTH4Q9UIA0 394 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa13.11□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 DSPP15924 2871 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa13.11□□□□□ -0.31
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PRAME-212ENST00000485532 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
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PRAME-212ENST00000485532 KCNT1Q5JUK3 1230 aa13.1□□□□□ -0.31
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PRAME-212ENST00000485532 SLCO6A1Q86UG4 719 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 TAC4Q86UU9 113 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 MFN1Q8IWA4 741 aa13.1□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 UNC45BQ8IWX7 931 aa13.1□□□□□ -0.31
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PRAME-212ENST00000485532 FAM149B1Q96BN6 582 aa13.1□□□□□ -0.31
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PRAME-212ENST00000485532 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 NBEAQ8NFP9 2946 aa13.1□□□□□ -0.31
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PRAME-212ENST00000485532 ATP1A3P13637 1013 aa13.09□□□□□ -0.31
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PRAME-212ENST00000485532 E2F5Q15329 346 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 STILQ15468 1287 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 ZNF423Q2M1K9 1284 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa13.09□□□□□ -0.31
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PRAME-212ENST00000485532 GOLGA1Q92805 767 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 TTC17Q96AE7 1141 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 BIRC7Q96CA5 298 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 SLC39A13Q96H72 371 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 MRGPRX3Q96LB0 322 aa13.09□□□□□ -0.31
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PRAME-212ENST00000485532 TM9SF3Q9HD45 589 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 TM7SF3Q9NS93 570 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 SERGEFQ9UGK8 458 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 BTBD3Q9Y2F9 522 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 SNX11Q9Y5W9 270 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 PKD1L2Q7Z442 2459 aa13.08□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 TMEM8BA6NDV4 472 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 FAM47DPA6NHR8 397 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 E5RJQ4 531 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 H0Y626 953 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TAF4O00268 1085 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 IRAK2O43187 625 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 SIN3BO75182 1162 aa13.08□□□□□ -0.32
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PRAME-212ENST00000485532 AFPP02771 609 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 DNTTP04053 509 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 C7P10643 843 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 RPL34P49207 117 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 CETN1Q12798 172 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 TAF5Q15542 800 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 KIF19Q2TAC6 998 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 DCAF6Q58WW2 860 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 RAP1GAP2Q684P5 730 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 MARCH9Q86YJ5 346 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAME-212ENST00000485532 APCDD1Q8J025 514 aa13.08□□□□□ -0.32
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