RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 DDIT4Q9NX09 232 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD36A6QL64 1941 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PQC6 194 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 C2CD4BA6NLJ0 364 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PAGE1O75459 146 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CNTN5O94779 1100 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ENDOD1O94919 500 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC11A2P49281 568 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 COPAP53621 1224 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 ATP11AP98196 1134 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 OGDHQ02218 1023 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 PTPRNQ16849 979 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PLK5Q496M5 336 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC14Q49A88 953 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ALFQ53S48 1182 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 EOGTQ5NDL2 527 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 MBLAC2Q68D91 279 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXL22Q6P050 247 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR59Q6PJI9 974 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 MON1BQ7L1V2 547 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CHSY1Q86X52 802 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB119Q8N690 84 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TSTD1Q8NFU3 115 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 FIBINQ8TAL6 211 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 HMGB4Q8WW32 186 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 GAB3Q8WWW8 586 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 EXOC4Q96A65 974 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ACDQ96AP0 544 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 BTN2A3PQ96KV6 586 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM7Q9C029 511 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 SIK2Q9H0K1 926 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM245Q9H330 911 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 SYNCQ9H7C4 482 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 GGA2Q9UJY4 613 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRK1Q38SD2 2015 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 KNL1Q8NG31 2342 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM72CH0Y354 149 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF103O00237 685 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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RABGEF1-206ENST00000461017 FERP16591 822 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFAIP3P21580 790 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 RRM1P23921 792 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CCR1P32246 355 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 SCNN1AP37088 669 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 P2RY2P41231 377 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CSKP41240 450 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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