RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434982.2

ANKRD55-202, Transcript of ankyrin repeat domain 55, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD55, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55-202ENST00000434982 BCAT1P54687 386 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 CREB5Q02930 508 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 ADIGQ0VDE8 80 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 PAK1Q13153 545 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 ELF2Q15723 593 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 DENND1CQ8IV53 801 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 ARHGAP18Q8N392 663 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF276Q8N554 614 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 LMO3Q8TAP4 145 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 TCEAL3Q969E4 200 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 LOXL4Q96JB6 756 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 ACOX2Q99424 681 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 RTKNQ9BST9 563 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ANKRD55-202ENST00000434982 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 YJEFN3A6XGL0 299 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 PRRT4C9JH25 899 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 E7ENQ6 273 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 M0QYV0 167 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 PMM2O15305 246 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 CACNG3O60359 315 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 AFPP02771 609 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 CISD3P0C7P0 127 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF806P0C7X5 589 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 ARAFP10398 606 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 MPLP40238 635 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 COG7P83436 770 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 CETN1Q12798 172 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 PMF1Q6P1K2 205 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 NETO1Q8TDF5 533 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 TCF12Q99081 682 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 RAD54BQ9Y620 910 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 WASH3PC4AMC7 463 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 J3QW42 95 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 SLC30A4O14863 429 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 P4HA2O15460 535 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 TSPAN3O60637 253 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 CAVIN2O95810 425 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 PAEPP09466 180 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 SETSIPP0DME0 302 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 HOXB2P14652 356 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 NTSR1P30989 418 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 UBE2HP62256 183 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 FANCCQ00597 558 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 FYB2Q5VWT5 728 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 PMS2CLQ68D20 193 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF787Q6DD87 383 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 CHPFQ8IZ52 775 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 DEFB119Q8N690 84 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 RNF139Q8WU17 664 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 DCLK3Q9C098 648 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 VPS45Q9NRW7 570 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 CLEC4EQ9ULY5 219 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD55-202ENST00000434982 CEP250Q9BV73 2442 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms