RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NNMTP40261 264 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GABRB2P47870 512 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF165P49910 485 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 JAM2P57087 298 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LMAN2Q12907 356 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCAPHQ15003 741 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 XYLT1Q86Y38 959 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DEFB119Q8N690 84 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR2T3Q8NH03 318 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WFDC5Q8TCV5 224 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD248Q9HCU0 757 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SUN2Q9UH99 717 aa16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC30A4O14863 429 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EPHB6O15197 1021 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GDF9O60383 454 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HLA-EP13747 358 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD6P30203 668 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OXTRP30559 389 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CSKP41240 450 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTGER3P43115 390 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF33AQ06730 810 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC12A1Q13621 1099 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C2CD6Q53TS8 623 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SYCP2LQ5T4T6 812 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF43Q68DV7 783 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC31Q6UY01 552 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RABEPKQ7Z6M1 372 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SYT12Q8IV01 421 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGL4Q8IZJ4 473 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF366Q8N895 744 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOXJ1Q92949 421 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPY6RQ99463 290 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EDEM2Q9BV94 578 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TKTL2Q9H0I9 626 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SIK2Q9H0K1 926 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM245Q9H330 911 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.77■□□□□ 0.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 THADAQ6YHU6 1953 aa16.77■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MEI4A8MW99 385 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PAGE1O75459 146 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DNTTP04053 509 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CFIP05156 583 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP1A3P13637 1013 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNA4P22459 653 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLHL40Q2TBA0 621 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCEAL3Q969E4 200 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYEOVQ96EZ4 313 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C11orf70Q9BRQ4 267 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIGVQ9NUD9 493 aa16.76■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERPINC1P01008 464 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FERP16591 822 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MMP8P22894 467 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RDXP35241 583 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HOXD12P35452 270 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LIMK1P53667 647 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ECT2LQ008S8 904 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FMO1Q01740 532 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SULT2A1Q06520 285 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PTPRNQ16849 979 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM61Q5EBN2 209 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FSCBQ5H9T9 825 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STPG1Q5TH74 334 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FBXL22Q6P050 247 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.75■□□□□ 0.27
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CEP76Q8TAP6 659 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms