RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 VCLP18206 1134 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TGM3Q08188 693 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MFSD4BQ5TF39 518 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RETSATQ6NUM9 610 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2R1Q6VVX0 501 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ENKURQ8TC29 256 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ACER1Q8TDN7 264 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD49Q8WVL7 239 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM237Q96Q45 408 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CBX4O00257 560 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ETS1P14921 441 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RAG1P15918 1043 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MSH3P20585 1137 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 IL12RB1P42701 662 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 BST2Q10589 180 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 STX4Q12846 297 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 C4orf19Q8IY42 314 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NACC2Q96BF6 587 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf16Q9BUW7 83 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 UGT2B28Q9BY64 529 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC167Q9P0B6 97 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 VAV3Q9UKW4 847 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BN98 237 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR182O15218 404 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN3O60637 253 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 STX11O75558 287 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ANXA6P08133 673 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 RARAP10276 462 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NOS3P29474 1203 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 LHX1P48742 406 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK7P50613 346 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 C21orf59P57076 290 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 STARD3Q14849 445 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 KCTD21Q4G0X4 260 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO47Q5MNV8 452 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM228AQ86W67 206 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 HDAC7Q8WUI4 952 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC39Q96DD0 335 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GON4LQ3T8J9 2241 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNK1O00180 336 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP7B1O75881 506 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 VAPBO95292 243 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 EGFRP00533 1210 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 THP07101 528 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PCNAP12004 261 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ALOX12P18054 663 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 YWHAQP27348 245 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 THPOP40225 353 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 GSSP48637 474 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC26A2P50443 739 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 TKTL1P51854 596 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMC3Q5W041 872 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF470Q6ECI4 717 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 FUKQ8N0W3 1084 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ASZ1Q8WWH4 475 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 VMP1Q96GC9 406 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MAN1C1Q9NR34 630 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1B0GUL6 1792 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 HS6ST1O60243 411 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PROCP04070 461 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 CRABP2P29373 138 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMC6P62333 389 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 XRCC4Q13426 336 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNMB4Q86W47 210 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 KBTBD2Q8IY47 623 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-202ENST00000426333 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms