RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CITO14578 2027 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 AURKAO14965 403 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM24O15164 1050 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 FKBP6O75344 327 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS23O95084 383 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LMNAP02545 664 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LIMK2P53671 638 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP1Q07960 439 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HHATQ5VTY9 493 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf46Q6P387 395 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD7Q7Z3H4 446 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF280CQ8ND82 737 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 VOPP1Q96AW1 172 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC2A13Q96QE2 648 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB6BQ9NRW1 208 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 OXSMQ9NWU1 459 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN16Q9UKR8 245 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMD13Q9UNM6 376 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0A0MRY4 1105 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LACTBL1A8MY62 500 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 C9IYK1 514 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT37O76014 449 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 IL18RAPO95256 599 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINE1P05121 402 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PDGFRAP16234 1089 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMA2P25787 234 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDX6P30041 224 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 STAT5BP51692 787 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 DYNLT1P63172 113 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MANEALQ5VSG8 457 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 FSTL4Q6MZW2 842 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA13Q96N96 652 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 BTBD2Q9BX70 525 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF302Q9NR11 478 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC3P53804 2025 aa3.73□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GTL3 188 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SDHDO14521 159 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD11O43934 449 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LPXNO60711 386 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SETSIPP0DME0 302 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC130P13994 396 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXC13P31276 330 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PEX19P40855 299 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RASSF2P50749 326 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TFDP2Q14188 446 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PDK2Q15119 407 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SYCP2LQ5T4T6 812 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PCGF5Q86SE9 256 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGVQ9NUD9 493 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 H0YIN7 160 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 H0YJX3 145 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PIRO00625 290 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 VDRP11473 427 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 EPHA3P29320 983 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH6P55285 790 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 KIZQ2M2Z5 673 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MYLK3Q32MK0 819 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 EFHC1Q5JVL4 640 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPT1Q8WYJ6 367 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PKMYT1Q99640 499 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ETAA1Q9NY74 926 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 UPK1AO00322 258 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GABRDO14764 452 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 MICAL2O94851 1124 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKCBP05771 671 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 TGM2P21980 687 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GLUD2P49448 558 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 GJA9P57773 515 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP11AP98196 1134 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A3Q01959 620 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 LRP8Q14114 963 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 ACAP2Q15057 778 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 CHI3L2Q15782 390 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 PPM1LQ5SGD2 360 aa3.72□□□□□ -1.81
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZNX1 250 aa3.72□□□□□ -1.81
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