RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 LOXL4Q96JB6 756 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 FAM81BQ96LP2 452 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 CCDC42Q96M95 316 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 CCDC140Q96MF4 163 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 SPAG5Q96R06 1193 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 RTKNQ9BST9 563 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ST7Q9NRC1 585 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 DTLQ9NZJ0 730 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.98□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ANO9A1A5B4 782 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 F8VZ95 297 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 DYNC1I1O14576 645 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 EXTL3O43909 919 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 AKR1B10O60218 316 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 KPNA6O60684 536 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.295e-24■□□□□ 8.4
CCL20-202ENST00000409189 GJB6O95452 261 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ADRB2P07550 413 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 MMP3P08254 477 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 TRIM49P0CI25 452 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 TRIM49CP0CI26 452 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 FERP16591 822 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ADSSP30520 456 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP25P42331 645 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 CYP24A1Q07973 514 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 DMWDQ09019 674 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 TUBB2AQ13885 445 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 CAPSQ13938 189 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 PLCB4Q15147 1175 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 SURF1Q15526 300 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 KIAA1328Q86T90 577 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 VPS36Q86VN1 386 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 CDIP1Q9H305 208 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 TLE6Q9H808 572 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 SIX2Q9NPC8 291 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CCL20-202ENST00000409189 HAS3O00219 553 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MAGEB2O15479 319 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ASAP2O43150 1006 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PJA2O43164 708 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LAMTOR5O43504 91 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 C22orf31O95567 290 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 WEE2P0C1S8 567 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MARK3P27448 753 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CASQ1P31415 396 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 THPOP40225 353 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ECI1P42126 302 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 STAT1P42224 750 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GNG11P61952 73 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 POU5F1BQ06416 359 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 KIF5AQ12840 1032 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 RAB33AQ14088 237 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SLC18A3Q16572 532 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DUSP6Q16828 381 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CBWD6Q4V339 395 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 KRT39Q6A163 491 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TEPPQ6URK8 271 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PPIL6Q8IXY8 311 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SEPT8Q92599 483 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms