RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 PSMG2Q969U7 264 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TBC1D31Q96DN5 1066 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TTC25Q96NG3 672 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 RUFY1Q96T51 708 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 VAT1Q99536 393 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 HINFPQ9BQA5 517 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 NEUROG2Q9H2A3 272 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 OSER1Q9NX31 292 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 MARCH2Q9P0N8 246 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 COX16Q9P0S2 106 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 YIPF1Q9Y548 306 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 HEY1Q9Y5J3 304 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 MTCH2Q9Y6C9 303 aa10.1□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 WDFY4Q6ZS81 3184 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 BRWD1Q9NSI6 2320 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF840PA6NDX5 716 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 C2CD2LO14523 706 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PRRG1O14668 218 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 CHADO15335 359 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TP73O15350 636 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TEX28O15482 410 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TLR5O60602 858 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 LPXNO60711 386 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PAGE1O75459 146 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 LRIG2O94898 1065 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 CXCL14O95715 111 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 LATS1O95835 1130 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 IFNB1P01574 187 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 NUDT17P0C025 328 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ALADP13716 330 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TSHRP16473 764 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 EPHB2P29323 1055 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 HSD17B3P37058 310 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 FDFT1P37268 417 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PMS2P54278 862 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 CDK16Q00536 496 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 GALNT2Q10471 571 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 C10orf120Q5SQS8 335 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 NPNTQ6UXI9 565 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 LRRC31Q6UY01 552 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 CNPY4Q8N129 248 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 FAM71DQ8N9W8 422 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL23Q8NBE8 558 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 GIPC2Q8TF65 315 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PLD4Q96BZ4 506 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 HDAC11Q96DB2 347 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TSGA13Q96PP4 275 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM109Q9BVC6 243 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 KLC2Q9H0B6 622 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 CD320Q9NPF0 282 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 DPP7Q9UHL4 492 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 INSL5Q9Y5Q6 135 aa10.09□□□□□ -0.79
POLR1A-202ENST00000409024 DRGXA6NNA5 263 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 GOLGA8KD6RF30 607 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 I6L893 689 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 KCNN4O15554 427 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 OPHN1O60890 802 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 SOAT2O75908 522 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 POU2F2P09086 479 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 RHOQP17081 205 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 RPL17P18621 184 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 CCNCP24863 283 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 RBL1P28749 1068 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 HOXA9P31269 272 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 NDST2P52849 883 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 GBE1Q04446 702 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 EFEMP1Q12805 493 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 C5orf22Q49AR2 442 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 CENPUQ71F23 418 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 TMC7Q7Z402 723 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 ELMOD1Q8N336 334 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 NAT8LQ8N9F0 302 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 MCUQ8NE86 351 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 HTR3CQ8WXA8 447 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 KLHL5Q96PQ7 755 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 SH3GL2Q99962 352 aa10.08□□□□□ -0.8
POLR1A-202ENST00000409024 FAM118BQ9BPY3 351 aa10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms