RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 FAM72DQ6L9T8 149 aa31.06■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 FAM72BQ86X60 149 aa31.06■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 PYROXD2Q8N2H3 581 aa31.06■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 NCAPGQ9BPX3 1015 aa31.06■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 USP18Q9UMW8 372 aa31.06■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 DRGXA6NNA5 263 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 SRGAP2O75044 1071 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-FP30511 346 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 EFHC2Q5JST6 749 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CARNMT1Q8N4J0 409 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 PDLIM2Q96JY6 352 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 TBC1D3BA6NDS4 549 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 PRPSAP2O60256 369 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 PROSCO94903 275 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 RPS9P46781 194 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC32Q14392 662 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC31Q6UY01 552 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CPNE8Q86YQ8 564 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 MFN1Q8IWA4 741 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC112Q8NEF3 446 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 FIBINQ8TAL6 211 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 DESI2Q9BSY9 194 aa31.05■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 KMT2EQ8IZD2 1858 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CNTN5O94779 1100 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 IL1R2P27930 398 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 AVPR2P30518 371 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 GEN1Q17RS7 908 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 ALFQ53S48 1182 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 FSCBQ5H9T9 825 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 ERMARDQ5T6L9 678 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 MANEALQ5VSG8 457 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 MPP6Q9NZW5 540 aa31.04■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1B0GVM2 712 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 TCAF2A6NFQ2 919 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 PRRT4C9JH25 899 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 FBXO43Q4G163 708 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 Q6ZS52 159 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 SYNPOQ8N3V7 929 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 LMLNQ96KR4 655 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 ABCB8Q9NUT2 735 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 LCMT1Q9UIC8 334 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 AP4E1Q9UPM8 1137 aa31.03■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 H0Y626 953 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CD70P32970 193 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 TNFRSF4P43489 277 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 VAV2P52735 878 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 KRT83P78385 493 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CCZ1BP86790 482 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CDH18Q13634 790 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 GAS6Q14393 721 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 MESDQ14696 234 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CA9Q16790 459 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 LACRTQ9GZZ8 138 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 SALL4Q9UJQ4 1053 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 NEU3Q9UQ49 428 aa31.02■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP6O43182 974 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 RNF40O75150 1001 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 LRIG2O94898 1065 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 L1CAMP32004 1257 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP25P42331 645 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 HADHBP55084 474 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 SEMA3BQ13214 749 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CHST9Q7L1S5 443 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 CHRDQ9H2X0 955 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 DUSP10Q9Y6W6 482 aa31.01■■■□□ 2.56
PKDCC-202ENST00000401498 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 CLDN11O75508 207 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 MAN1A1P33908 653 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 CDH4P55283 916 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 SEC13P55735 322 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 LMAN2Q12907 356 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 EMC10Q5UCC4 262 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM215Q68D42 235 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 NUDT18Q6ZVK8 323 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 GGA2Q9UJY4 613 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 HCN2Q9UL51 889 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 PJA2O43164 708 aa31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 NOP2P46087 812 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
PKDCC-202ENST00000401498 KCNT1Q5JUK3 1230 aa31■■■□□ 2.55
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