RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 MACC1Q6ZN28 852 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 CERKQ8TCT0 537 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 PHF21BQ96EK2 531 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 MRIQ9BWK5 157 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 DDIT4Q9NX09 232 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 STK39Q9UEW8 545 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 MGAT4DA6NG13 374 aa9.06□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 EML1O00423 815 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 EGFRP00533 1210 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 GH1P01241 217 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 CYP3A7P24462 503 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 EVX2Q03828 476 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 MGAT5Q09328 741 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 COX10Q12887 443 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 XRCC4Q13426 336 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF284Q2VY69 593 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 FAM83AQ86UY5 434 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.06□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 RXFP2Q8WXD0 754 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 CHKBQ9Y259 395 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.06□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 AKAP5P24588 427 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 STX4Q12846 297 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 STK32CQ86UX6 486 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 DHFR2Q86XF0 187 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 BAP1Q92560 729 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 PWWP2AQ96N64 755 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 CYP24A1Q07973 514 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 GNA13Q14344 377 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 TAF5Q15542 800 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 NEK5Q6P3R8 708 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 ACOT1Q86TX2 421 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 ACP6Q9NPH0 428 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 TAS2R14Q9NYV8 317 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WXM4 84 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 STAG3L1P0CL83 205 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 DACT2Q5SW24 774 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 POLG2Q9UHN1 485 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 CROTQ9UKG9 612 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 TMEM114B3SHH9 223 aa9.05□□□□□ -0.96
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PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A27O95847 323 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 IFNGR2P38484 337 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 GSSP48637 474 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 CHN2P52757 468 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.05□□□□□ -0.96
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