RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 B2RBV5 119 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 KITP10721 976 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 GRK2P25098 689 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 CERS2Q96G23 380 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC40Q9H9A6 602 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 RRN3Q9NYV6 651 aa23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 H0Y3Z8 333 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PTGESO14684 152 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 CAPN9O14815 690 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 MTSS1O43312 755 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 SERPINE1P05121 402 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TREML1Q86YW5 311 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 RILPQ96NA2 401 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC106Q9BWC9 280 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT82Q9NSB4 513 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ENO1P06733 434 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 GNAT1P11488 350 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP3K7CLP57077 242 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 DAOAP59103 153 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 SEMA3BQ13214 749 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 DNAL1Q4LDG9 190 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 KATNAL1Q9BW62 490 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 CEP41Q9BYV8 373 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 CNGB3Q9NQW8 809 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TSC2P49815 1807 aa23.68■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 AP2A1O95782 977 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 MYL3P08590 195 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ERCC2P18074 760 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PTPN3P26045 913 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC1A6P48664 564 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 LHX1P48742 406 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TPI1P60174 286 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC6Q16204 474 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 C16orf46Q6P387 395 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ULBP1Q9BZM6 244 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PSAT1Q9Y617 370 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PROCP04070 461 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 FKBP1BP68106 108 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 IRX4P78413 519 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ARL13BQ3SXY8 428 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 STMN2Q93045 179 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ISL2Q96A47 359 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 BFARQ9NZS9 450 aa23.67■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 NRP1O14786 923 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PSMG1O95456 288 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 FYNP06241 537 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP6V1C1P21283 382 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TYK2P29597 1187 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 MAP2K5Q13163 448 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 ACSBG2Q5FVE4 666 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 MORN1Q5T089 497 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP4R1Q8TF05 950 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 MIEF2Q96C03 454 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 SENP8Q96LD8 212 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 CRTAC1Q9NQ79 661 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 TRHDEQ9UKU6 1024 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 F9P00740 461 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 MX2P20592 715 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 VHLP40337 213 aa23.66■■□□□ 1.38
RABGGTA-202ENST00000399409 PCLAFQ15004 111 aa23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms