RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 CAV1Q03135 178 aa25.28■■□□□ 1.64
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ECHDC3-201ENST00000379215 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa25.28■■□□□ 1.64
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ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF683Q8IZ20 524 aa25.28■■□□□ 1.64
ECHDC3-201ENST00000379215 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
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ECHDC3-201ENST00000379215 RHOP08100 348 aa25.27■■□□□ 1.64
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ECHDC3-201ENST00000379215 C14orf80Q86SX3 495 aa25.26■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 FAM71DQ8N9W8 422 aa25.26■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 CPQQ9Y646 472 aa25.26■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 KCNN4O15554 427 aa25.26■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 C5orf22Q49AR2 442 aa25.26■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 PCGF5Q86SE9 256 aa25.26■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 DENND1CQ8IV53 801 aa25.26■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.26■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 HDAC11Q96DB2 347 aa25.26■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa25.25■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 RBL1P28749 1068 aa25.25■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 ADGRF1Q5T601 910 aa25.25■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 NLRP14Q86W24 1093 aa25.25■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 TASP1Q9H6P5 420 aa25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 USP29Q9HBJ7 922 aa25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 GKN1Q9NS71 199 aa25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 SMPD4Q9NXE4 827 aa25.25■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 EPOPA6NHQ4 379 aa25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 MAPKAPK2P49137 400 aa25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 NPWQ8N729 165 aa25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 HTR3CQ8WXA8 447 aa25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 PIDD1Q9HB75 910 aa25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 GRHL1Q9NZI5 618 aa25.24■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 OBSL1O75147 1896 aa25.24■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 SMAPO00193 183 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 MAP3K6O95382 1288 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 MYBL2P10244 700 aa25.23■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 AVPR1AP37288 418 aa25.23■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 NDST2P52849 883 aa25.23■■□□□ 1.63
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ECHDC3-201ENST00000379215 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 GPS1Q13098 491 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 ARTNQ5T4W7 220 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 GPR158Q5T848 1215 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 CCNYQ8ND76 341 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 ART4Q93070 314 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 CAVIN3Q969G5 261 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC22A12Q96S37 553 aa25.23■■□□□ 1.63
ECHDC3-201ENST00000379215 CYP2S1Q96SQ9 504 aa25.23■■□□□ 1.63
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