RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361219.10

SERBP1-201, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERBP1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1-201ENST00000361219 EPHB2P29323 1055 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 GRIK1P39086 918 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 PID1Q7Z2X4 250 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 VPS11Q9H270 941 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.62■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ALDH1A2O94788 518 aa20.61■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 GSTA1P08263 222 aa20.61■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 CSH1P0DML2 217 aa20.61■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 CSH2P0DML3 217 aa20.61■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF276Q8N554 614 aa20.61■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 RNF34Q969K3 372 aa20.61■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.61■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.61■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 WDR27A2RRH5 827 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 TRPA1O75762 1119 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 GNRH1P01148 92 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 INHAP05111 366 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 PYGBP11216 843 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 RNF43Q68DV7 783 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 MTBPQ96DY7 904 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 NAT9Q9BTE0 207 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 PLXNA3P51805 1871 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 KRT38O76015 456 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 OR4Q2P0C623 313 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ETV4P43268 484 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 TTC17Q96AE7 1141 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 NEU3Q9UQ49 428 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 VWA8A3KMH1 1905 aa20.6■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 H0YHG0 523 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 UGT1A9O60656 530 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 PGAM1P18669 254 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 MGAT1P26572 445 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 OR1G1P47890 313 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 CASC4Q6P4E1 433 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 CCDC63Q8NA47 563 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 HAPLN3Q96S86 360 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 VAT1Q99536 393 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 CREBZFQ9NS37 354 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 TTC3P53804 2025 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 COL6A1P12109 1028 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 CCNFP41002 786 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 SERPINB9P50453 376 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 SCD5Q86SK9 330 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.59■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ARVCFO00192 962 aa20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 AP2A1O95782 977 aa20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 HTR7P34969 479 aa20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 CRADDP78560 199 aa20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ZNF33AQ06730 810 aa20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 CHSY1Q86X52 802 aa20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 DPF3Q92784 378 aa20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 GBA3Q9H227 469 aa20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 MKS1Q9NXB0 559 aa20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SERBP1-201ENST00000361219 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SERBP1-201ENST00000361219 COPEO14579 308 aa20.57■□□□□ 0.88
SERBP1-201ENST00000361219 RFPL1O75677 317 aa20.57■□□□□ 0.88
SERBP1-201ENST00000361219 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SERBP1-201ENST00000361219 CNTFP26441 200 aa20.57■□□□□ 0.88
SERBP1-201ENST00000361219 HOXC13P31276 330 aa20.57■□□□□ 0.88
SERBP1-201ENST00000361219 CCR1P32246 355 aa20.57■□□□□ 0.88
SERBP1-201ENST00000361219 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.57■□□□□ 0.88
SERBP1-201ENST00000361219 ZBTB17Q13105 803 aa20.57■□□□□ 0.88
SERBP1-201ENST00000361219 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms