RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 CXCR3P49682 368 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 VSNL1P62760 191 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DYNLT1P63172 113 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CCNG2Q16589 344 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NTAN1Q96AB6 310 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 YIPF1Q9Y548 306 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CST8O60676 142 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PFDN1O60925 122 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZMYND10O75800 440 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CCDC159P0C7I6 412 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MCM3P25205 808 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ALDH1A3P47895 512 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LIG3P49916 1009 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HSD17B7P56937 341 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TAF10Q12962 218 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 EFHC2Q5JST6 749 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 BBS12Q6ZW61 710 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RNF139Q8WU17 664 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CASP10Q92851 521 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAF2Q96CS3 445 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RNF157Q96PX1 679 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HINFPQ9BQA5 517 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZNF670Q9BS34 389 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HPS4Q9NQG7 708 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GDF3Q9NR23 364 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAM187AA6NFU0 413 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 C5orf67F2Z3F1 127 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PRRG1O14668 218 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LIASO43766 372 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF15O94989 841 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ERVFC1P60507 584 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GUCY2DQ02846 1103 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SCAPQ12770 1279 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SHHQ15465 462 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LRRC31Q6UY01 552 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TMC7Q7Z402 723 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HAUS1Q96CS2 278 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TCF25Q9BQ70 676 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 WDCPQ9H6R7 721 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 IRAK2O43187 625 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SGTAO43765 313 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CSH1P0DML2 217 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CSH2P0DML3 217 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RARGP13631 454 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DNAJB1P25685 340 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TNFRSF8P28908 595 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ADRA1BP35368 520 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 KCNJ1P48048 391 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TWF1Q12792 350 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TFDP2Q14188 446 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 JAMLQ86YT9 394 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 IFT20Q8IY31 132 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PQLC3Q8N755 202 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TTC13Q8NBP0 860 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RNF34Q969K3 372 aa6.24□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SERPINB11Q96P15 392 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms