RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 FAM107BQ9H098 131 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 PLAC1Q9HBJ0 212 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 WBP1LQ9NX94 342 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 NCAM2O15394 837 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TBX18O95935 607 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 GARSP41250 739 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TAF10Q12962 218 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 LRRC14Q15048 493 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 PARP6Q2NL67 630 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 KLHL38Q2WGJ6 581 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 C1orf53Q5VUE5 145 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MSANTD2Q6P1R3 559 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 C14orf80Q86SX3 495 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD42Q8N9B4 389 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 GIPC2Q8TF65 315 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 PAFAH2Q99487 392 aa18.38■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 DHRS4Q9BTZ2 278 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 PPCSQ9HAB8 311 aa18.38■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PPM1 405 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 FAM92AA1XBS5 289 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
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ACTB-201ENST00000331789 KRT15P19012 456 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MX2P20592 715 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 SERPINB6P35237 376 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 EFEMP1Q12805 493 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MANEALQ5VSG8 457 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ADGRD1Q6QNK2 874 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 FBXO22Q8NEZ5 403 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 DCAKDQ8WVC6 231 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 HDAC11Q96DB2 347 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 SPATA17Q96L03 361 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MLXIPLQ9NP71 852 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 FETUBQ9UGM5 382 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TLR6Q9Y2C9 796 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ACTL7BQ9Y614 415 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 COL4A6Q14031 1691 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 CPP00450 1065 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MSH2P43246 934 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 IFNAR2P48551 515 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TBX4P57082 545 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 NR1H3Q13133 447 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 SPARCL1Q14515 664 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 RASA2Q15283 850 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D31Q96DN5 1066 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 SLC39A13Q96H72 371 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ZNF333Q96JL9 665 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 CYTH2Q99418 400 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 BRD8Q9H0E9 1235 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TRABDQ9H4I3 376 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 WDR27A2RRH5 827 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 SPAG7O75391 227 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 FAM107AO95990 144 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 HOXC13P31276 330 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 TUBP50607 506 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 SARNPP82979 210 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 SMARCB1Q12824 385 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB17Q13105 803 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 USP41Q3LFD5 358 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 PIK3R6Q5UE93 754 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 LRRC39Q96DD0 335 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 IGSF21Q96ID5 467 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.534e-25■□□□□ 10.3
ACTB-201ENST00000331789 E9PAM4 449 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 DFFAO00273 331 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 C2CD2LO14523 706 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 SPAG6O75602 509 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 CLTBP09497 229 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 OR1D2P34982 312 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 PSMD5Q16401 504 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 UNC5AQ6ZN44 842 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 AGAP3Q96P47 875 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTB-201ENST00000331789 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
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