RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326828.5

CHRNA3-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 3 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA3, Length 3,202 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3-201ENST00000326828 KYQ8NBH2 561 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 GAB3Q8WWW8 586 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 ATP9BO43861 1147 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 ATG7O95352 703 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 MT-CO1P00395 513 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 PRKCBP05771 671 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 PSMD7P51665 324 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 CEACAM7Q14002 265 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 KRT80Q6KB66 452 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 BTBD9Q96Q07 612 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 WRNIP1Q96S55 665 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 AGAP2Q99490 1192 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.65□□□□□ -0.06
CHRNA3-201ENST00000326828 SLX4Q8IY92 1834 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 STRNO43815 780 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 NLRP7Q8WX94 980 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 SGF29Q96ES7 293 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 SCYL1Q96KG9 808 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 MRIQ9BWK5 157 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 SNX15Q9NRS6 342 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 SYBUQ9NX95 663 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 SNX13Q9Y5W8 968 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 PSMC3P17980 439 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 MX2P20592 715 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 SDC4P31431 198 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 SERPINB8P50452 374 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 CCR3P51677 355 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 ADGRE1Q14246 886 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 TAZQ16635 292 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 CCDC14Q49A88 953 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 KLHL35Q6PF15 583 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 DCLK2Q8N568 766 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 CCNYL1Q8N7R7 359 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 DMTF1Q9Y222 760 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 CNTN2Q02246 1040 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 RALGDSQ12967 914 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 AMHR2Q16671 573 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 POTEAQ6S8J7 498 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 RIN3Q8TB24 985 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 SERPINI1Q99574 410 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.64□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 CNTNAP1P78357 1384 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 C2CD4BA6NLJ0 364 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 TMEM233B4DJY2 109 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 KCNK1O00180 336 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 VWA5AO00534 786 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF195O14628 629 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 OGTO15294 1046 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 HOXC6P09630 235 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 HDCP19113 662 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 IL23RQ5VWK5 629 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 GPRASP2Q96D09 838 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 CIB1Q99828 191 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 CDH19Q9H159 772 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 WDR41Q9HAD4 459 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 STK39Q9UEW8 545 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 TK2O00142 265 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 DPP6P42658 865 aa14.63□□□□□ -0.07
CHRNA3-201ENST00000326828 GPD2P43304 727 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms