RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 CCL16O15467 120 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ERLIN1O75477 346 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ITGAVP06756 1048 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 GOT1P17174 413 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 DYNLT1P63172 113 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 LLGL1Q15334 1064 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ELF2Q15723 593 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 TMCO3Q6UWJ1 677 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 SLC35B2Q8TB61 432 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ACTL9Q8TC94 416 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC114Q96M63 670 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 CORO1BQ9BR76 489 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 FAM129AQ9BZQ8 928 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ATXN3LQ9H3M9 355 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF4Q9NR80 690 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF148Q9UQR1 794 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 V9GYY5 206 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 MUC6Q6W4X9 2439 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM221A6NGB7 291 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 M0R296 226 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 RAD51CO43502 376 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 OLFM2O95897 454 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 TBX18O95935 607 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 HDCP19113 662 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 MX2P20592 715 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 EPHB2P29323 1055 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 DRG2P55039 364 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 DPYSQ14117 519 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 NOMO1Q15155 1222 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R7Q15435 360 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 MAP9Q49MG5 647 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 GSTA5Q7RTV2 222 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 PQLC3Q8N755 202 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC89Q8N998 374 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 HERPUD2Q9BSE4 406 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 SIK2Q9H0K1 926 aa18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
SYNE4-201ENST00000324444 LRIG2O94898 1065 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
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SYNE4-201ENST00000324444 HOXC13P31276 330 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 SLC7A9P82251 487 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 CUL1Q13616 776 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 BRD3Q15059 726 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 C4orf22Q6V702 233 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 LRRC49Q8IUZ0 686 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 BBOF1Q8ND07 529 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 ERP44Q9BS26 406 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 PIDD1Q9HB75 910 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 TRPC7Q9HCX4 862 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 FAM114A2Q9NRY5 505 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 HS3ST4Q9Y661 456 aa18.57■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 E9PAM4 449 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 ACSL4O60488 711 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 RBP3P10745 1247 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 ERCC2P18074 760 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 AMPD1P23109 780 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 TNFRSF8P28908 595 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 ACTN2P35609 894 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 ADCY2Q08462 1091 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 SIGLEC14Q08ET2 396 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 SNX1Q13596 522 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 PDK1Q15118 436 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 JAMLQ86YT9 394 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 RSAD2Q8WXG1 361 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 PARD6BQ9BYG5 372 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 LIMD1Q9UGP4 676 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 RAB21Q9UL25 225 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 DNPEPQ9ULA0 475 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 HEY1Q9Y5J3 304 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 MYO10Q9HD67 2058 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.56■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 WASH4PA8MWX3 477 aa18.55■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 F5H5T6 163 aa18.55■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 H7C0C1 242 aa18.55■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 DCLK1O15075 740 aa18.55■□□□□ 0.56
SYNE4-201ENST00000324444 TTI1O43156 1089 aa18.55■□□□□ 0.56
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