RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289175.10

LRRFIP1-202, Transcript of LRR binding FLII interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRFIP1, Length 3,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1-202ENST00000289175 KCNA4P22459 653 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 GDF10P55107 478 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 DSG1Q02413 1049 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 BOLA3Q53S33 107 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 TMEM110Q86TL2 294 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 LHX5Q9H2C1 402 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 K7ERQ8 282 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FBXL22Q6P050 247 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 GOLGA8RI6L899 631 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 HERVK_113Q902F9 699 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 KLK6Q92876 244 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 CACNA1GO43497 2377 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 CTPS1P17812 591 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 TMEM25Q86YD3 366 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FBXO21O94952 628 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PLA2G4AP47712 749 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 COG7P83436 770 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 TFDP2Q14188 446 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 EMC10Q5UCC4 262 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PALM2Q8IXS6 379 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 DCLK2Q8N568 766 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 IGSF8Q969P0 613 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PSMG2Q969U7 264 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 SERPINB11Q96P15 392 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 J3KR12 359 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 RAMP2O60895 175 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 MAN1A1P33908 653 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 POU6F1Q14863 301 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 CHPFQ8IZ52 775 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 VGLL3A8MV65 326 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PLK4O00444 970 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FYNP06241 537 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 GRIA1P42261 906 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 CCDC157Q569K6 752 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 XKR4Q5GH76 650 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PBKQ96KB5 322 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 SPEGQ15772 3267 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 RFX8Q6ZV50 586 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 JAMLQ86YT9 394 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PRELID2Q8N945 189 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FGF13Q92913 245 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 ERLIN1O75477 346 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FAM153BP0C7A2 387 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 SGSHP51688 502 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 PTP4A2Q12974 167 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 RAB30Q15771 203 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FAM153CQ494X1 144 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 ALS2CLQ60I27 953 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 FAM153AQ9UHL3 310 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRFIP1-202ENST00000289175 E9PAM4 449 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms