RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gdap1O88741 358 aa17.28■□□□□ 0.36
Nisch-221ENSMUST00000171735 CenpcP49452 906 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bpifb5Q3UQ05 490 aa17.28■□□□□ 0.36
Nisch-221ENSMUST00000171735 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa17.28■□□□□ 0.36
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ubn1Q4G0F8 1135 aa17.28■□□□□ 0.36
Nisch-221ENSMUST00000171735 Scube2Q9JJS0 997 aa17.28■□□□□ 0.36
Nisch-221ENSMUST00000171735 SpaarA0A1B0GSZ0 75 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nhsl2B1AXH1 854 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kctd18E0CZ26 429 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zfp850J3QPC5 689 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ncf2O70145 525 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccnb1P24860 430 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ptger1P35375 405 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Smpdl3aP70158 445 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sdr16c6Q05A13 316 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Znrf3Q5SSZ7 913 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pik3r5Q5SW28 871 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gngt1Q61012 74 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Q6P2K3 674 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Baiap3Q80TT2 1134 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Iars2Q8BIJ6 1012 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bicd1Q8BR07 835 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sit1Q8C503 180 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Epn3Q91W69 636 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ubox5Q925F4 539 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prl5a1Q9JII2 230 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sema4fQ9Z123 777 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Piezo2Q8CD54 2822 aa17.27■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm28510A0A087WP28 240 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mmrn1B2RPV6 1210 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm5415E9PXF3 478 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Apold1E9Q0X2 246 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 NoctO35710 429 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 DgkaO88673 730 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 PrlP06879 226 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zfy2P20662 777 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sash1P59808 1230 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 SbdsP70122 250 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Brms1lQ3U1T3 323 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 TceancQ3US16 359 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Taar7eQ5QD09 358 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Olfr26Q7TRB7 308 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Epb41l5Q8BGS1 731 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cnot10Q8BH15 744 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trpa1Q8BLA8 1125 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 B130006D01RikQ8BRH6 153 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sh3rf3Q8C120 878 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Smtnl2Q8CI12 456 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fbxo21Q8VDH1 627 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc65Q8VHI7 493 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gps1Q99LD4 471 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 LrgukQ9D5S7 820 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 SyncQ9EPM5 470 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Olfr933Q9EQA0 308 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mcm3apQ9WUU9 1971 aa17.26■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zscan5bB2RTN3 468 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lipo2D3YY49 398 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Speer4f2E9Q366 295 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 RaxO35602 342 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Folr1P35846 255 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 SykP48025 629 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defa-rs12P50716 91 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zhx1P70121 873 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cct5P80316 541 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tex11Q14AT2 947 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ugt3a1Q3UP75 523 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gpr19Q61121 415 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc117Q6PB51 277 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 RbsnQ80Y56 783 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Taf5Q8C092 801 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Atoh8Q99NA2 322 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lrrc17Q9CXD9 443 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Syap1Q9D5V6 365 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Xpo7Q9EPK7 1087 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tubd1Q9R1K7 455 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm9573F7C950 1606 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 PtprfA2A8L5 1898 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm6588E9Q3K0 461 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Coro1aO89053 461 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zfp1P08042 402 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 RhoP15409 348 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trim71Q1PSW8 855 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Serpinb6Q60854 378 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Syn2Q64332 586 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Foxo6Q70KY4 559 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zbtb24Q80X44 710 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Armc12Q80X86 340 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 AgmoQ8BS35 447 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Enpp4Q8BTJ4 456 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gramd4Q8CB44 633 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Acsl5Q8JZR0 683 aa17.25■□□□□ 0.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zfp566Q8VCI1 386 aa17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.9 ms