RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641425.1

CASC19-231, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 1,156 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-231	ENST00000641425	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	POMK	Q9H5K3	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	NTM	Q9P121	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	DERA	Q9Y315	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MYH10	P35580	1976 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	C22orf46	C9J442	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ARNTL	O00327	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SOAT2	O75908	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	AKAP3	O75969	853 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	OAZ2	O95190	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SMC2	O95347	1197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	VNN2	O95498	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TNNC2	P02585	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ADRB1	P08588	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TYMP	P19971	482 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	LMO2	P25791	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CNR2	P34972	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MTHFR	P42898	656 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CDH8	P55286	799 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MYL6	P60660	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	UBE2H	P62256	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TRPC3	Q13507	836 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PSMD6	Q15008	389 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MYADM	Q96S97	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	UBE4B	O95155	1302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CASC19-231	ENST00000641425	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CASC19-231	ENST00000641425	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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