RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152		E7ENQ6	273 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152		H3BRJ5	948 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	AXL	P30530	894 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CRHR1	P34998	444 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	FDFT1	P37268	417 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CCNF	P41002	786 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SESN3	P58005	492 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PDE1B	Q01064	536 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CRYM	Q14894	314 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PPM1J	Q5JR12	505 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RILP	Q96NA2	401 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	GLTPD2	A6NH11	291 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	KLF11	O14901	512 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	DAB1	O75553	588 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	GSTA2	P09210	222 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2B6	P20813	491 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CALB2	P22676	271 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SCNN1A	P37088	669 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CDKL2	Q92772	493 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	LPP	Q93052	612 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NPY6R	Q99463	290 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	HACD1	B0YJ81	288 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152		I6L893	689 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	GSC2	O15499	205 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	BPGM	P07738	259 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	NCAM1	P13591	858 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ABCG1	P45844	678 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINB9	P50453	376 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CACNA2D1	P54289	1103 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM17	P78536	824 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	OCRL	Q01968	901 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	KDSR	Q06136	332 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PDK1	Q15118	436 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PACS1	Q6VY07	963 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	EDEM1	Q92611	657 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	WNT8B	Q93098	351 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	C7orf26	Q96N11	449 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	EBF4	Q9BQW3	602 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ZFAT	Q9P243	1243 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	OPHN1	O60890	802 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	WFS1	O76024	890 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TOMM70	O94826	608 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FYN	P06241	537 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CTSH	P09668	335 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ERCC2	P18074	760 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CBLB	Q13191	982 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	STX3	Q13277	289 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO27	Q8NI29	283 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	SENP8	Q96LD8	212 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	GAD1	Q99259	594 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	APOL2	Q9BQE5	337 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	ITM2A	O43736	263 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC6	O75061	913 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	AP1G2	O75843	785 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BRF1-222	ENST00000635152	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	13.45	□□□□□ -0.26

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