RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC36A4Q6YBV0 504 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR3DQ70Z44 454 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SMARCD1Q96GM5 515 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRG3Q99928 467 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 IMPG2Q9BZV3 1241 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 COMMD8Q9NX08 183 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 OSER1Q9NX31 292 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CNTN6Q9UQ52 1028 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP33O14559 1287 aa25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPC3Q13507 836 aa25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF18AQ8NI77 898 aa25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A17Q9H1V8 727 aa25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT82Q9NSB4 513 aa25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 MARK1Q9P0L2 795 aa25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 NENFQ9UMX5 172 aa25.2■■□□□ 1.63
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF5CO60282 957 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 TLR5O60602 858 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA1P43355 309 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 BPIFB4P59827 614 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF5AQ12840 1032 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP44Q17R89 818 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 TATDN2Q93075 761 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ERLEC1Q96DZ1 483 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 INTUQ9ULD6 942 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP8B1Q9UNU6 501 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 OPHN1O60890 802 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 AP1G2O75843 785 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CISD3P0C7P0 127 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC130P13994 396 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ARID5AQ03989 594 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1328Q86T90 577 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ACOT1Q86TX2 421 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 HDDC3Q8N4P3 179 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPA12BQ96MM6 686 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMK1GQ96NX5 476 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 MED10Q9BTT4 135 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD54BQ9Y620 910 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087X0T9 212 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 BTNL10A8MVZ5 291 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 HHLA1C9JL84 531 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM228BP0C875 321 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 TYRP14679 529 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ORC1Q13415 861 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CUL2Q13617 745 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF699Q32M78 642 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 MRGPRX1Q96LB2 322 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CYLDQ9NQC7 956 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 H0Y626 953 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF217O75362 1048 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM16O95361 564 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 RABEPKQ7Z6M1 372 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CRYBG2Q8N1P7 616 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 TNIP3Q96KP6 325 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 NMUR1Q9HB89 426 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 NAGPAQ9UK23 515 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO10Q9UK96 956 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 WASH3PC4AMC7 463 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF667Q5HYK9 610 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZNB5 142 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF677Q86XU0 584 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CHPFQ8IZ52 775 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 KAT5Q92993 513 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 AGPAT1Q99943 283 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 BBS2Q9BXC9 721 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 LZTFL1Q9NQ48 299 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 LHX6Q9UPM6 363 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.627e-11■■■■■ 42.7
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3BP5O60239 455 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ACO1P21399 889 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 TERF1P54274 439 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K7CLP57077 242 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-216ENST00000628306 TPGS1Q6ZTW0 290 aa25.15■■□□□ 1.62
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