RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 KRT7P08729 469 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 GPD2P43304 727 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ADCY2Q08462 1091 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 PDCLQ13371 301 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TAZQ16635 292 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 FBXL6Q8N531 539 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 MIS12Q9H081 205 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CENPHQ9H3R5 247 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 AP1G2O75843 785 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SHBGP04278 402 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC130P13994 396 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 PSMC3P17980 439 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 PSMA2P25787 234 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 AVPR1AP37288 418 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CDKN2BP42772 138 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CACNA2D1P54289 1103 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 PPP2R2AP63151 447 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 PFKPQ01813 784 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 GRM2Q14416 872 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 HADHQ16836 314 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 FAM35AQ86V20 835 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 RELL1Q8IUW5 271 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 YAF2Q8IY57 180 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 FUKQ8N0W3 1084 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 FLCNQ8NFG4 579 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC114Q96M63 670 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 KCNK16Q96T55 309 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 HEPACAM2A8MVW5 462 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ERBB2P04626 1255 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 FCARP24071 287 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.164e-6■□□□□ 10.2
SGMS1-210ENST00000619438 LSP1P33241 339 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 GJC1P36383 396 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TXNDC8Q6A555 127 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 BRD9Q9H8M2 597 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.29■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 LRCH4O75427 683 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ADORA2BP29275 332 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ADCY8P40145 1251 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ITGA8P53708 1063 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ODF2Q5BJF6 829 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 VITQ6UXI7 678 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 NUP93Q8N1F7 819 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 RAPGEF5Q92565 580 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 EPN3Q9H201 632 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 SYNCQ9H7C4 482 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 KRT82Q9NSB4 513 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.28■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 M0QYV0 167 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 NDC80O14777 642 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 GDI1P31150 447 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 MON1AQ86VX9 555 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
SGMS1-210ENST00000619438 AGTP01019 485 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 FAM200BP0CF97 657 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 KRT10P13645 584 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 MAP3K7CLP57077 242 aa22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SGMS1-210ENST00000619438 USP46P62068 366 aa22.26■■□□□ 1.15
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