RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJB2P25686 324 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SLC1A6P48664 564 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 XIAPP98170 497 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 QPRTQ15274 297 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SCGB2A1O75556 95 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CYP2C8P10632 490 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ARFIP1P53367 373 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SSTP61278 116 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 INSCQ1MX18 579 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 GALNTL6Q49A17 601 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 DHFR2Q86XF0 187 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SIK2Q9H0K1 926 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 RAG1P15918 1043 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 UGT1A5P35504 534 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 RFC5P40937 340 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 TBCELQ5QJ74 424 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PIK3R3Q92569 461 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2R1Q13018 1463 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEB2O15479 319 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CST8O60676 142 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SIN3BO75182 1162 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PSMB9P28065 219 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CDK7P50613 346 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CAV3P56539 151 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PRKAA1Q13131 559 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2E3Q969T4 207 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PAFAH2Q99487 392 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 WWOXQ9NZC7 414 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PADI4Q9UM07 663 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 FOXN1O15353 648 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 LDLRP01130 860 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 MYBL2P10244 700 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 NR1H2P55055 460 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 EPHA7Q15375 998 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 EPC2Q52LR7 807 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ALFQ53S48 1182 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SLC26A11Q86WA9 606 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SPASTQ9UBP0 616 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 POLIQ9UNA4 740 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRT-209ENST00000612229 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CCDC154A6NI56 674 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 H3BUI4 141 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ULK1O75385 1050 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 LAYNQ6UX15 382 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 REEP2Q9BRK0 252 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SNX7Q9UNH6 387 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 EGFRP00533 1210 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H2ABP04908 130 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 GSTM1P09488 218 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 NR2C2P49116 596 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 RGS1Q08116 209 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PROX1Q92786 737 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 FAM50BQ9Y247 325 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CLOCKO15516 846 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 WFS1O76024 890 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 MYL9P24844 172 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 IL5RAQ01344 420 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PLD1Q13393 1074 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 NEDD8Q15843 81 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 C4orf46Q504U0 113 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 AKAP14Q86UN6 197 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 APOPT1Q96IL0 206 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.12□□□□□ -1.27
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