RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	OR2T3	Q8NH03	318 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	GATA6	Q92908	595 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	FOXJ1	Q92949	421 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	LHX5	Q9H2C1	402 aa		13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
FCHO1-233	ENST00000600393	BICDL2	A1A5D9	508 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	LATS1	O95835	1130 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	IGLV3-19	P01714	112 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SYP	P08247	313 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	GPD2	P43304	727 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC11A2	P49281	568 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CAMK4	Q16566	473 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MFN1	Q8IWA4	741 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	AHI1	Q8N157	1196 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	LMLN	Q96KR4	655 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MED15	Q96RN5	788 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM131	Q92545	1883 aa		13.39	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A1B0GTW7	788 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393		A0A1B0GVT2	93 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	FAM170A	A1A519	330 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	METTL12	A8MUP2	240 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393		E5RJQ4	531 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	P4HA2	O15460	535 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	THAP12	O43422	761 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	FBXO21	O94952	628 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	GNS	P15586	552 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CSK	P41240	450 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CETN1	Q12798	172 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ACAP1	Q15027	740 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	STIL	Q15468	1287 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TAF5	Q15542	800 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	FSCB	Q5H9T9	825 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MYO19	Q96H55	970 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	NUP58	Q9BVL2	599 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ITPR1	Q14643	2758 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	BECN2	A8MW95	431 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	TIMM44	O43615	452 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	OXTR	P30559	389 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PPP1R2	P41236	205 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF445	P59923	1031 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	RING1	Q06587	406 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CDH18	Q13634	790 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	PASD1	Q8IV76	773 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	NAXD	Q8IW45	347 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		13.37	□□□□□ -0.27
FCHO1-233	ENST00000600393	GAREM1	Q9H706	876 aa		13.37	□□□□□ -0.27

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