RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 LPPQ93052 612 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 TDP1Q9NUW8 608 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 CDH7Q9ULB5 785 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 KCNN4O15554 427 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 CYTH3O43739 400 aa6.45□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 CNTFP26441 200 aa6.45□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 FAM228AQ86W67 206 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 KSR1Q8IVT5 923 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 MCUQ8NE86 351 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 SNF8Q96H20 258 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 PSME2Q9UL46 239 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC78A2IDD5 438 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 ACSL4O60488 711 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 MICAL2O94851 1124 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 AGXTP21549 392 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 CDK16Q00536 496 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 STK4Q13043 487 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.45□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 MMEL1Q495T6 779 aa6.45□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 C9J4A7 227 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 H3BQF6 201 aa6.45□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 CER1O95813 267 aa6.45□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 GRIA2P42262 883 aa6.45□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 INSCQ1MX18 579 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 NXNQ6DKJ4 435 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 C3orf20Q8ND61 904 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 APOL5Q9BWW9 433 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 VPS45Q9NRW7 570 aa6.45□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 SPASTQ9UBP0 616 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.45□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 SNED1Q8TER0 1413 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.44□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 M0R3G1 203 aa6.44□□□□□ -1.38
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SMAD4-212ENST00000591126 KRT14P02533 472 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 RHOQP17081 205 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 CNR2P34972 360 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 CASRP41180 1078 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 39.8
SMAD4-212ENST00000591126 FSCBQ5H9T9 825 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 LRRC38Q5VT99 294 aa6.44□□□□□ -1.38
SMAD4-212ENST00000591126 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.44□□□□□ -1.38
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