RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.27□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPAN3O60637 253 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LILRA1O75019 489 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 XYLBO75191 536 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K6O95382 1288 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV3-25P01717 112 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KLKB1P03952 638 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CKMP06732 381 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RARAP10276 462 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PYGMP11217 842 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RALAP11233 206 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT10P13645 584 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FOSL2P15408 326 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RHOQP17081 205 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HDCP19113 662 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNA5P22460 613 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CASQ1P31415 396 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SCNN1AP37088 669 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 VIPR2P41587 438 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN9P43378 593 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SGSHP51688 502 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TBX4P57082 545 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX16P57768 344 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HECTD3Q5T447 861 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 BNIPLQ7Z465 357 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR149Q86SP6 731 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SCML4Q8N228 414 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 COG1Q8WTW3 980 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RAPGEF5Q92565 580 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA1Q92805 767 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CD101Q93033 1021 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF34Q969K3 372 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 P2RY11Q96G91 374 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 MYADMQ96S97 322 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 POMKQ9H5K3 350 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 COMMD8Q9NX08 183 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 USP18Q9UMW8 372 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CPQQ9Y646 472 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP290O15078 2479 aa6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CLUHO75153 1309 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRD1A4D1F6 860 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNK3O14649 394 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CREB3O43889 395 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PAGE1O75459 146 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 STC2O76061 302 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF8O76064 485 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 GLI1P08151 1106 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CTNNA2P26232 953 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC25CP30307 473 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXA9P31269 272 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC6A4P31645 630 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CHRNA4P43681 627 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCR3P49682 368 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PEX5P50542 639 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 EPHA5P54756 1037 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 DYNLT1P63172 113 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TFF2Q03403 129 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 ADCY2Q08462 1091 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS6KA1Q15418 735 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 KAZNQ674X7 775 aa6.25□□□□□ -1.41
CAPNS1-208ENST00000589162 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.25□□□□□ -1.41
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