RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 K7ESM1 405 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 M0R2N6 131 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SCAMP1O15126 338 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CASC3O15234 703 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 NKX2-8O15522 239 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 COCHO43405 550 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 HUS1O60921 280 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ATP2C2O75185 946 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TOM1L1O75674 476 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PIAS2O75928 621 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 C8BP07358 591 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ADRB2P07550 413 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 UQCRHP07919 91 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 JMJD7P0C870 316 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FAM200BP0CF97 657 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 IRF1P10914 325 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 VDRP11473 427 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 HGFP14210 728 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 BDNFP23560 247 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PAX7P23759 505 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ANXA13P27216 316 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 YWHAQP27348 245 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ATICP31939 592 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 USP8P40818 1118 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TXKP42681 527 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 NPTX2P47972 431 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LHX1P48742 406 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MFAP3P55082 362 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PEX3P56589 373 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SESN3P58005 492 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ARID5AQ03989 594 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PPP2R3AQ06190 1150 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 OVGP1Q12889 678 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TMED1Q13445 227 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SEPT6Q14141 434 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ECM1Q16610 540 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CDKN3Q16667 212 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DEFB109BQ30KR1 87 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FILIP1LQ4L180 1135 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 JADE1Q6IE81 842 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FAM171BQ6P995 826 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CRTC1Q6UUV9 634 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SASS6Q6UVJ0 657 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 VSTM1Q6UX27 236 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 C4orf50Q6ZRC1 276 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CLEC17AQ6ZS10 378 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 USP30Q70CQ3 517 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TAS1R3Q7RTX0 852 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 NEK8Q86SG6 692 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 IQCHQ86VS3 1027 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ZSCAN30Q86W11 494 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SKAP1Q86WV1 359 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CATSPER3Q86XQ3 398 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC83Q8IWF9 413 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SMC5Q8IY18 1101 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 BLIDQ8IZY5 108 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF366Q8N895 744 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FAM184AQ8NB25 1140 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 OR2T34Q8NGX1 318 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SPATA3Q8NHX4 192 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 WDR48Q8TAF3 677 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 RUFY2Q8WXA3 655 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SORCS1Q8WY21 1168 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GOLGA1Q92805 767 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 KIFAP3Q92845 792 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 USP7Q93009 1102 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 KLHDC7BQ96G42 594 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC34Q96HJ3 373 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LURAP1Q96LR2 239 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CEP295NLQ96MC4 621 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 C5orf34Q96MH7 638 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SLITRK1Q96PX8 696 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PKMYT1Q99640 499 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MDFIQ99750 246 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DUSP23Q9BVJ7 150 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TTLL2Q9BWV7 592 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SLC26A6Q9BXS9 759 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CIPCQ9C0C6 399 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CCSER1Q9C0I3 900 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 STRADBQ9C0K7 418 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 HAPLN2Q9GZV7 340 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PRSS16Q9NQE7 514 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 KMT5AQ9NQR1 393 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms