RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PTPRM-206	ENST00000578093	MYLK	Q15746	1914 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SH3BP5	O60239	455 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GJB3	O75712	270 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NFATC1	O95644	943 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	OLFM2	O95897	454 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PRB1	P04280	392 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GABRG2	P18507	467 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ADSS	P30520	456 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DDIT3	P35638	169 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	WAS	P42768	502 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NEK4	P51957	841 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF131	P52739	623 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TSPY1	Q01534	308 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LMAN2	Q12907	356 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNB1	Q14721	858 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DHCR24	Q15392	516 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NKG7	Q16617	165 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SV2C	Q496J9	727 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MIPEP	Q99797	713 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DSE	Q9UL01	958 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DERA	Q9Y315	318 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CPQ	Q9Y646	472 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1W2PQF6	199 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GABRD	O14764	452 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	C1QL1	O75973	258 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KAT7	O95251	611 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SERPINF2	P08697	491 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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