RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	ACSL4	O60488	711 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	OPHN1	O60890	802 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	NDUFV2	P19404	249 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	CLCN1	P35523	988 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SCAP	Q12770	1279 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	KCNMA1	Q12791	1236 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PDCL	Q13371	301 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM215	Q68D42	235 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	BEND5	Q7L4P6	421 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PASD1	Q8IV76	773 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	ADAM32	Q8TC27	787 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SERPINB11	Q96P15	392 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	CIPC	Q9C0C6	399 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	LHX5	Q9H2C1	402 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		18.17	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	NPC1	O15118	1278 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	CD59	P13987	128 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC6A4	P31645	630 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	KRT9	P35527	623 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	IL12RB1	P42701	662 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SGSH	P51688	502 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	ENPP2	Q13822	863 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	TAF5	Q15542	800 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PDZD3	Q86UT5	571 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC39A13	Q96H72	371 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	CAPN10	Q9HC96	672 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147		H0Y626	953 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	IRAK2	O43187	625 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	AP5Z1	O43299	807 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SH3BP5	O60239	455 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	TBL1X	O60907	577 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF217	O75362	1048 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	TRIM16	O95361	564 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SERPINF2	P08697	491 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	HLA-F	P30511	346 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	ARID5A	Q03989	594 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	NNT	Q13423	1086 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF234	Q14588	700 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	STARD3	Q14849	445 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	E2F5	Q15329	346 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	FUT11	Q495W5	492 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	MPP7	Q5T2T1	576 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	TAC4	Q86UU9	113 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	CPXM1	Q96SM3	734 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RNPS1-222	ENST00000567147	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	BPTF	Q12830	3046 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	BPIFB4	P59827	614 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF33A	Q06730	810 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	DCAF6	Q58WW2	860 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RNPS1-222	ENST00000567147	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49

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