RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565160.5

BBS4-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 4, human

TSL 3

Gene BBS4, Length 681 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS4-208	ENST00000565160	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160		Q8N1X5	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	RAD9A	Q99638	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	MAST3	O60307	1309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	BSN	Q9UPA5	3926 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	POLQ	O75417	2590 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BBS4-208	ENST00000565160	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160		H3BML4	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	EYA2	O00167	538 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	SLC30A4	O14863	429 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	MARCH6	O60337	910 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	RECQL4	O94761	1208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	UBXN7	O94888	489 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	AGFG2	O95081	481 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	FCER1A	P12319	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	TYR	P14679	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	AOC1	P19801	751 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	OCA2	Q04671	838 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	TFCP2	Q12800	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	COASY	Q13057	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	PKP1	Q13835	747 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	PLS1	Q14651	629 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	CCDC6	Q16204	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	CENPE	Q02224	2701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS4-208	ENST00000565160	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms