RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 K7ESF4 209 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 SERPINC1P01008 464 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 APODP05090 189 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 TDGF1P13385 188 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 PTMSP20962 102 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 STAT1P42224 750 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 HARS2P49590 506 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 MRE11P49959 708 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 CCR3P51677 355 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 FMO1Q01740 532 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 NFKBIBQ15653 356 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 LPAL2Q16609 132 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 DCAF6Q58WW2 860 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 FYB2Q5VWT5 728 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 RFWD3Q6PCD5 774 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 ERICH1Q86X53 443 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 ALLCQ8N6M5 410 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 USP33Q8TEY7 942 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 DDI1Q8WTU0 396 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 PLD4Q96BZ4 506 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 NOX5Q96PH1 765 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 HHIPQ96QV1 700 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 DCLK3Q9C098 648 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 STIM2Q9P246 746 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 DEC1Q9P2X7 70 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 HCN2Q9UL51 889 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 CEP83Q9Y592 693 aa8.55□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 PRRT4C9JH25 899 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 GJB6O95452 261 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 IGLV3-27P01718 113 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 CISD3P0C7P0 127 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 SLC6A4P31645 630 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 CHKAP35790 457 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 NBL1P41271 181 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 GRIA2P42262 883 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 DGKGP49619 791 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 NUMBP49757 651 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 NOMO3P69849 1222 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 FANCCQ00597 558 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 SLC6A3Q01959 620 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 NME3Q13232 169 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 DMC1Q14565 340 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 NR1I3Q14994 352 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 MEA1Q16626 185 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 GEN1Q17RS7 908 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 FBXO43Q4G163 708 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 DNAAF5Q86Y56 855 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 EXOC4Q96A65 974 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 C18orf8Q96DM3 657 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 ACOX2Q99424 681 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 MARK1Q9P0L2 795 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 INVSQ9Y283 1065 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.54□□□□□ -1.04
LINS1-211ENST00000560941 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms